یکی از بیماری های مهم فلفل دلمه ای ، آتشک روی فلفلدلمهای است. عامل ایجادکننده این بیماری باکتری است. که معمولا به دو دسته «آتشک اولیه» و «آتشک پسین» تقسیم میشوند.
از علائم این بیماری می توان به لکههای بزرگ قهوهای روی برگ و پژمردگی، ساقههای قهوهای یا سیاه در پایه گیاه، پوسیدگی ریشه (که باعث بیماری گیاه میشود)، پوسیدگی میوه (وقتی در تماس با خاک آلوده است) اشاره کرد.پوسیدگی ریشه یکی از علائم اولیه این بیماری های فلفل دلمه ای است.